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1 黃帝內經明堂敘一卷舊鈔太素經校本敘一卷黃帝內經九卷集注敘一卷黃帝內經素問重校正敘一卷 未詳
2 四益易說一卷 撰著者
3 易經新義疏證凡例一卷 撰著者
4 易生行譜例言一卷 撰著者
5 易經古本一卷 撰著者
6 尚書今文新義一卷 撰著者
7 書尚書弘道編一卷 撰著者
8 今文尚書要義凡例一卷 撰著者
9 書經周禮皇帝疆域圖表四十二卷 撰著者
10 書經大統凡例一卷 撰著者
11 四益詩說一卷 撰著者
12 今文詩古義證疏凡例一卷 撰著者
13 周官考徵凡例 一卷 周禮新義凡例 一卷 撰著者
14 周禮鄭注商榷 一卷 撰著者
15 周禮訂本略注 三卷 撰著者
16 禮經凡例 一卷 附容經學凡例 一卷 撰著者
17 禮記識 二卷 撰著者
18 王制學凡例 一卷 撰著者
19 王制訂 一卷 撰著者
20 王制集說 一卷 撰著者
21 坊記新解 一卷 撰著者
22 分撰兩戴記章句凡例 一卷 撰著者
23 禮說 一卷 撰著者
24 樂經凡例 一卷 撰著者
25 左氏春秋古經說 十二卷 撰著者
26 春秋左傳古義凡例 一卷 撰著者
27 何氏公羊解詁十論 一卷 續十論 一卷 再續十論 一卷 春秋天子二伯方伯卒正附庸尊卑表 一卷 撰著者
28 公羊春秋經傳驗推補證 十一卷 首 一卷 擬大統春秋條例 一卷 皇帝大同學革弊興利百目 一卷 撰著者
29 公羊春秋補證凡例 一卷 撰著者
30 起起穀梁廢疾 一卷 撰著者
31 重訂榖梁春秋經傳古義疏 十一卷 釋範 一卷 起起榖梁廢疾 一卷 撰著者
32 榖梁春秋經傳古義凡例 一卷 撰著者
33 縠梁春秋經學外篇凡例 一卷 撰著者
34 春秋三傳折中 一卷 撰著者
35 春秋圖表 二卷 撰著者
36 論語彙解凡例 一卷 撰著者
37 大學中庸演義 一卷 撰著者
38 孝經學凡例 一卷 撰著者
39 經話甲編 二卷 乙編 一卷 撰著者
40 經學初程 一卷 撰著者
41 四益館經學四變記 一卷 五變記 二卷 撰著者
42 今古學考 二卷 撰著者
43 古學考 一卷 撰著者
44 六書舊義一卷 撰著者
45 釋笵一卷 撰著者
46 書中候弘道篇一卷 撰著者
47 詩緯新解一卷 撰著者
48 莊子新解一卷 撰著者
49 莊子經說敘意一卷 撰著者
50 墨辯解故序一卷 撰著者
51 尊孔篇一卷附錄一卷 撰著者
52 知聖篇二卷 撰著者
53 靈素五解篇一卷附素問靈臺祕典論篇新解一卷瘧解補證一卷 撰著者
54 素問隋楊氏太素注本目錄一卷 撰著者
55 靈樞隋楊氏太素注本目錄一卷 撰著者
56 營衛運行楊注補證一卷 撰著者
57 補傷寒古本一卷 撰著者
58 傷寒古本考不分卷 撰著者
59 傷寒講義一卷附桂枝湯講義一卷 撰著者
60 傷寒總論一卷 撰著者
61 太素內經傷寒總論補證一卷太素四時病補證一卷 撰著者
62 傷寒平議不分卷附瘟疫平議一卷 撰著者
63 分方治宜篇一卷 撰著者
64 脉經考證一卷 撰著者
65 平脉政一卷內經平脉考一卷 撰著者
66 黃帝內經太素診皮篇補證一卷古經診皮名詞一卷 撰著者
67 診筋篇補證一卷附十二筋病表一卷 撰著者
68 診骨篇補證一卷 撰著者
69 楊氏太素診絡篇補證三卷病表一卷名詞一卷 撰著者
70 黃帝太素人迎脉口診補證(一名人寸診補證)二卷 撰著者
71 楊氏太素三部診法補證一卷九候篇診法補證一卷附十二經動脉表一卷 撰著者
72 脉學輯要評三卷 撰著者
73 漢志三統曆表一卷 撰著者
74 撼龍經傳訂本注一卷 撰著者
75 都天寶照經一卷 撰著者
76 地學答問一卷 撰著者
77 地理辨正補正三卷 撰著者
78 命理支中藏幹釋例一卷 撰著者
79 偸理約編 一卷 附錄 一卷 撰著者
80 世界哲理進化退化演說 一卷 撰著者
81 傷寒雜病論古本一卷 編纂者
82 巢氏病源補養宣導法二卷 編纂者